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PT-BR: Insuficiência Real Aguda (IRA) em pacientes internados pelo setor de Cardiologia do HU-UFPI

Descrição do Projeto

Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um modelo de Aprendizado de Máquina Supervisionado para inferência de Insuficiência Renal Aguda (IRA) de pacientes internados no Hospital Universitário da Universidade Federal do Piauí (HU-UFPI) no setor de cardiologia entre os anos de 2018 e 2022. Abordando aquisição, tratamento, análise, desenvolvimento, avaliação e implementação como WebApp.

Versionamento

Objeto	Versão	Data de Atualização
Notebook	2.5	27/02/2024
WebApp	1.5	27/02/2024

Estrutura do Projeto

IRA-Analysis-HU-UFPI/
|-- notebooks/
| |-- ira_analysis.ipynb
|-- data/
| |-- raw/
| | |-- creatinina_pacientes.csv
| | |-- controle_pacientes.csv
| |-- processed/
| | |-- ______.csv
| |-- final/
| | |-- ______.csv
|-- models/
| |-- modelo-1.pkl
|-- reports/
| |-- _________.pdf
| |-- ...
|-- src/
| |-- utils.py
|-- app/
| |-- webapp.py
|-- requirements.txt
|-- Makefile |-- README.md

• notebooks: Contém o Jupyter Notebook principal para a análise dos dados e desenvolvimento dos modelos.

• data:

  • raw: Armazena os dados brutos extraídos do banco AGHU.
  • processed: Local para salvar dados processados durante a análise.
  • final: Destinado aos dados finais após a conclusão da análise.

• models: Contém os modelos de machine learning treinados, salvos em formato pickle (.pkl).

• reports: Armazena os relatórios e documentos gerados durante a análise, como o relatório final em PDF.

• src: Código-fonte e utilitários para a análise, como o arquivo utils.py.

• app: Possui arquivos relacionados a aplicação web para uso de validação do modelo, com o arquivo webapp.py.

• requirements.txt: Lista as dependências do projeto para replicação.

• README.md: Documentação principal do projeto, incluindo informações sobre a estrutura, configuração e execução do código.

Preparação do Ambiente Virtual

Para a replicação do projeto, é necessário a criação de um ambiente virtual com as dependências necessárias.

• dependencias basicas:
  • python >= 3.11
  • pip 20.0.2
  • git 2.25.1

Após assegurar que as dependências básicas estão instaladas, acesse o terminal e navegue até a pasta raiz do projeto. Em seguida, execute os seguintes comandos:

make prepare-env

Execução do Web App

Para executar o web app, basta executar o seguinte comando no terminal dentro da pasta raiz do projeto:

make iniciar-webapp

O Web App estará disponível no endereço http://localhost:8080/.

Autores

Nome	Lattes	Email
Gabriel Feitosa Melo Coelho	Link	[email protected]
Francisco Luciani de Miranda Vieira	Link	[email protected]

Consentimento de Uso de Dados

Esta projeto foi desenvolvido como parte do projeto __________, encabeçada pela residente _______, sob orientação do prof. Dr. ______. Os dados utilizados são de propriedade do Hospital Universitário da UFPI e foram cedidos para o desenvolvimento desta análise.

EN: Acute Real Insufficiency (ARF) in patients admitted to the Cardiology department of HU-UFPI